Новое в августовской оценке 2024

Создано: 21.08.2024, 08:10

С целью интеграции новых данных и повышения точности оценок CDCB (Совет по селекции молочного скота) и AGIL (Лаборатория исследований генома и совершенствования животных МСХ США) объявляют о ряде обновлений в генетических оценках, выходящих три раза в год, которые внедрены с выходом следующей из них - 13 августа 2024 года.

В числе августовских изменений, детально о которых рассказано в совместной публикации CDCB и AGIL, значатся следующие:

305-AA - новая система стандартизованного измерения молочной продуктивности: 305-AA заменит собой 305-ME при расчетах генетических оценок CDCB. Вступает в действие в августе 2024. С середины июня 2024 года оценки продуктивности отдельных животных на основе 305-AA стали доступны при помощи запросов CDCB WebConnect. Поскольку 305-AA основан на недавнем анализе в условиях современного молочного производства это изменение позволяет проводить более объективное фенотипическое сравнение надоев при помощи учета продуктивности коров разного возраста, количества отелов и сезона отела в пересчете на стандартизированное (нормализованное) молоко.
Расчетные идентификаторы: Оценка августа 2024 г. станет первой из выходящих 3 раза в год, в которой будет полностью внедрена расчетная идентификация во всей базе данных CDCB. Как уже сообщалось ранее, в ежемесячные и еженедельные оценки расчетные идентификаторы были полностью внедрены со 2 июля 2024 года. Для получения расчетной идентификации используется идентификация предков при помощи геномного анализа, позволяющая построить более полные родословные животных, у которых ранее отсутствовали данные о связи с предками по материнской линии. Это повышает точность оценки животных.
Жизнеспособность телок: Были улучшены редактирование и моделирование признака "жизнеспособность телок" (HLV), что значительно улучшит как оценки HLV для быков, данные о дочерях которых имелись в последние два года, так и геномные прогнозы для потомства этих быков.
Расположение задних сосков у коров бурой швицкой породы (RTP): Этот признак будет доступен как в традиционных, так и в геномных оценках августа 2024 года для бурой швицкой породы. Традиционные оценки (полученные только по данным о производственных показателях) включают в себя RTP в качестве отдельного признака, в настоящее время не коррелирующего с другими признаками. Затем эти значения обеспечивают оценку RTP для всех 72 с лишним тысяч генотипированных животных бурой швицкой породы.
Новый список снипов (SNP): Набор из 78 964 генетических маркеров, генных тестов и количественных локусов признаков, используемых в геномных прогнозах с 2021 года, был обновлен, и теперь в нем 69 200 снипов. Проведение этой ревизии, стартующей в августе 2024 года, очень мало повлияет на оценки и позволит сосредоточиться на наиболее важных и новых маркерах, одновременно сократив время обработки данных системой. Удаленные маркеры не оказывали большого воздействия на признаки, не включались в последние версии чипов или имели более низкое качество генотипа. Кроме того, было добавлено пять новых генных тестов. Ревизия списка снипов может повлиять на статус носителя для немного большего процента животных, поскольку некоторые гаплотипы теперь включают иной набор маркеров.
Ежегодное обновление представленности породного базиса (BBR): В 2024 году обновление вступает в силу в августе (а не в апреле, как ранее), чтобы использовать новый набор из 69 200 снипов. Результаты тестового запуска оказались сопоставимы с предыдущими ежегодными изменениями BBR и подтвердили ограниченное влияние очищенного списка снипов.
Генные тесты HH6 и JNS в расчетах гаплотипов: В расчет гаплотипов HH6 (голштинская порода) и JNS (нейропатия с разведенными передними конечностями у джерсеев) теперь будут включены данные прямого генного теста.